Với sự tiến bộ của các chiến lược trình tự quy mô lớn, bộ gen của vi sinh vật trong cộng đồng thoát nước mỏ axit được sắp xếp trực tiếp từ môi trường. Các cấu trúc di truyền gần như đầy đủ cho phép hiểu biết mới của cộng đồng và có thể tái tạo lại đường trao đổi chất của họ. Những kiến thức về Acidophiles thoát nước mỏ axit vẫn còn thô sơ: chúng ta biết về nhiều loài hơn kết hợp với ARD hơn chúng ta có thể thiết lập vai trò và chức năng.